Sammanfattning
Anledning till studien:
Bakteriesamhället i tarmen är en viktig faktor för hästens tarmhälsa och hälsa i hela kroppen. Att förstå bakteriesamhällets struktur och funktion utgör en viktig grund för studier av tarmhälsa och tarmsjukdomar.
Syfte:
Att beskriva bakteriesamhället i träcken samt de flyktiga organiska föreningarna (VOCs) i träckens metabolom hos friska fullblodshästar i aktiv galoppträning, samt att karakterisera hästarnas svar på utfodringstillskott med amylasrikt maltextrakt.
Studieupplägg:
Interventionsstudie.
Metoder:
Träckprover samlades in på ett icke-invasivt sätt före samt sex veckor efter tillskottet hos åtta privatägda fullblodshästar i aktiv galoppträning. Träckens metabolom karakteriserades med hjälp av termisk desorption-gaskromatografi-masspektrometri (TD-GC-MS). Spektralanalysen genomfördes med AMDIS och jämfördes med NIST-databasen.
Den taxonomiska sammansättningen av mikrobiotan i träcken analyserades med hjälp av felkorrigerade data från 454-pyrosekvensering av amplikon från 16S rRNA-gener.
Resultat:
Träckens metabolom hos hästarna i studien dominerades av organiska syror, alkoholer och ketoner. Forskarna identifierade 81 olika flyktiga organiska föreningar (VOCs), varav endast 28 förekom i mer än 50 % av proverna, vilket visar på en stor funktionell mångfald.
Profilerna av flyktiga organiska föreningar i träcken skilde sig mellan den första och den andra provtagningen. Vissa VOCs minskade signifikant efter tillskottet, vilket överensstämmer med en tydlig respons på utfodring med det amylasrika maltextraktet.
Mikrobiotan i träcken visade sig vara mycket diversifierad. Proverna uppvisade en verifierbar mångfald på mellan 1 200 och 3 000 operationella taxonomiska enheter (OTU:er) per individ. Metoderna visade även på en hög förekomst av mindre frekventa bakteriegrupper med låg abundans.
Sammansättningen av det mikrobiella samhället i träcken visade sig skilja sig efter utfodringstillskottet. Skillnader upptäcktes i flera bakteriegrupper med låg abundans, och det fanns även vissa tecken på individuella variationer mellan hästarna i deras respons på tillskottet.
Slutsatser:
Den flyktiga metabolomen i träcken hos fullblodshästar i galoppträning domineras av organiska syror, alkoholer och ketoner. Studien visar att utfodring med amylasrikt maltextrakt kan förändra profilen av flyktiga organiska föreningar (VOCs) signifikant.
Mikrobiomet i träcken är mycket diversifierat och domineras av bakteriegrupperna Firmicutes och Bacteroidetes. Små men signifikanta förändringar i bakteriesamhällets sammansättning kunde identifieras efter utfodringstillskottet.
Studien beskriver metabolomet och mikrobiomet i träcken hos friska fullblodshästar och utgör därmed en referens för framtida studier av sjukdomar och kostrelaterade interventioner.
Originaltexten är på engelska
