Resumé
Årsag til studien:
Bakteriesamfundet i tarmen er en vigtig faktor for hestens tarmhelbred og generelle sundhed. Forståelse af bakteriesamfundets struktur og funktion udgør et vigtigt grundlag for studier af tarmhelbred og tarmsygdomme.
Formål:
At beskrive bakteriesamfundet i fækalierne samt de flygtige organiske forbindelser (VOCs) i fækaliernes metabolom hos raske fuldblodsheste i aktiv galoptræning, samt at karakterisere hestenes respons på foderingstilskud med amylaseholdigt malttekstrakt.
Studiedesign:
Interventionsstudie.
Metoder:
Fækalprøver blev indsamlet på en ikke-invasiv måde før samt seks uger efter tilskuddet hos otte privat ejede fuldblodsheste i aktiv galoptræning. Fækaliernes metabolom blev karakteriseret ved hjælp af termisk desorption-gaskromatografi-massespektrometri (TD-GC-MS). Spektralanalysen blev udført med AMDIS og sammenlignet med NIST-databasen.
Den taksonomiske sammensætning af mikrobiotaen i fækalierne blev analyseret ved hjælp af fejlkorrigerede data fra 454-pyrosekventering af amplikoner fra 16S rRNA-gener.
Resultater:
Fækaliernes metabolom hos hestene i studien var domineret af organiske syrer, alkoholer og ketoner. Forskerne identificerede 81 forskellige flygtige organiske forbindelser (VOCs), hvoraf kun 28 forekom i mere end 50 % af prøverne, hvilket vidner om et stort funktionelt mangfold.
Profilerne af flygtige organiske forbindelser i fækalierne varierede mellem den første og den anden prøvetagning. Nogle VOCs faldt signifikant efter tilskuddet, hvilket stemmer overens med en tydelig respons på fodering med det amylaseholdige malttekstrakt.
Mikrobiotaen i fækalierne viste sig at være meget diversificeret. Prøverne udviste et verificerbart mangfold på mellem 1.200 og 3.000 operationelle taksonomiske enheder (OTU'er) per individ. Metoderne viste også en høj forekomst af mindre hyppige bakteriegrupper med lav abundans.
Sammensætningen af det mikrobielle samfund i fækalierne viste sig at variere efter foderingstilskuddet. Forskelle blev opdaget i flere bakteriegrupper med lav abundans, og der var også visse tegn på individuelle variationer mellem hestene i deres respons på tilskuddet.
Konklusioner:
Det flygtige metabolom i fækalierne hos fuldblodsheste i galoptræning er domineret af organiske syrer, alkoholer og ketoner. Studiet viser, at fodering med amylaseholdigt malttekstrakt kan ændre profilen af flygtige organiske forbindelser (VOCs) signifikant.
Mikrobiomet i fækalierne er meget diversificeret og domineres af bakteriegrupperne Firmicutes og Bacteroidetes. Små, men signifikante ændringer i bakteriesamfundets sammensætning kunne identificeres efter foderingstilskuddet.
Studiet beskriver metabolomet og mikrobiomet i fækalierne hos raske fuldblodsheste og udgør dermed en reference for fremtidige studier af sygdomme og kostrelaterede interventioner.
Originalteksten er på engelsk
